Данное структурное подразделение основано 26 февраля 1998 года. По истечении года оно было преобразовано в магистратуру по подготовке руководящих кадров для органов внутренних дел. На основании постановления Кабинета Министров Республики Узбекистан от 23 сентября 2004 года «О мерах по совершенствованию подготовки специалистов для органов внутренних дел в Академии МВД Республики Узбекистан» были организованы Высшие академические курсы. В разные годы коллективом руководили Р.Саитбаев, F.Алимов, И.Мирзараимов, У.Мухамедов.
С 2017 года Высшие академические курсы снова получили статус Факультета подготовки руководящих кадров. Основной целью факультета является подготовка высококвалифицированных руководящих кадров, обладающих качествами организации и руководства в деятельности органов внутренних дел, отвечающих духовным и нравственным требованиям, поставленным перед руководителем органа внутренних дел.
На учёбу на факультет могут поступить сотрудники из числа офицерского состава, имеющие высшее образование, не старше 40 лет, имеющие практический стаж работы в органах внутренних дел не менее семи лет (при этом период учебы в дневной форме обучения не учитывается), несущие службу в должности не менее одного года, способные по своим личным и деловым качествам, состоянию здоровья и физической подготовки выполнять служебные обязанности сотрудника органов внутренних дел.
На сегодняшний день факультет готовит квалифицированные кадры по специальности «Управленческая деятельность органов внутренних дел». В пределах годовой учебной программы слушатели изучают 26 дисциплин по семи учебным модулям. Учебный процесс осуществляется с применением передовых инновационных технологий и интерактивных методов. Новая учебная литература, учебники и учебные пособия по специальности обеспечивают проведение учебных занятий в духе современных требований. Занятия проводятся как профессорско-преподавательским составом, так и практическими сотрудниками органов внутренних дел, обладающими богатым опытом и знаниями. В свою очередь, слушатели во время прохождения квалификационной практики закрепляют полученные теоретические знания.
Слушателям, успешно окончившим факультет подготовки руководящих кадров, по итогам государственной аттестации присваивается квалификация «Менеджмент», выдаётся соответствующий диплом и нагрудный знак.