Первоначально кафедра боевой и физической подготовки осуществляла деятельность в качестве цикла военной, боевой и физической подготовки. В 1978 году на базе цикла были созданы две самостоятельные кафедры – военно-мобилизационной и тактико-специальной подготовки; боевой и физической подготовки. Коллектив кафедры боевой и физической подготовки возглавил мастер спорта по легкой атлетике И.Чувилин.
В разные годы кафедру возглавляли Заслуженный тренер по боксу Б.Гранаткин, М.Утаев, Заслуженный тренер Узбекистана Ф.Пулатов, А.Кочкаров, мастер спорта международного класса А.Курбонов и др.
С обретением независимости на кафедре была проведена масштабная работа по дальнейшей популяризации спорта, поддержке способной молодежи, созданию всех необходимых условий для занятий физической культурой и спортом. Представители образовательного учреждения стали занимать призовые места на республиканских, азиатских и мировых чемпионатах по самбо, дзюдо, каратэ, таэквондо, боксу, тяжелой атлетике, вольной и греко-римской борьбе и другим видам спорта. За минувшие годы сотрудники и курсанты Академии стали обладателями около 500 медалей чемпионатов Азии и мира, более 100 из которых – золотые. Известные мастера спорта – Акобир Курбонов, Ботир Усмонов, Фахриддин Пулатов, Латиф Латипов, Марина Кодирова стали обладателями званий «Лучший тренер года» и «Лучший спортсмен года» Республики Узбекистан. В настоящее время на кафедре боевой и физической подготовки функционируют секции самбо, боевого самбо и дзюдо, рукопашного боя и вольной борьбы, служебного многоборья и легкой атлетики, футбола, волейбола. Занятия проводят квалифицированные преподаватели-тренера Академии, опытные мастера спорта.